Obiectivele Programului-pilot sunt:
1) dezvoltarea social-economică echilibrată și durabilă pe întreg teritoriul Republicii Moldova;
2) dezvoltarea economică a regiunilor prin sprijinirea întreprinderilor mici și mijlocii, cu accent sporit pe inovare, transfer de tehnologii și dezvoltare durabilă;
3) atragerea investițiilor și promovarea regiunilor în calitate de poli de dezvoltare.